随着农产品产量的进一步增高，人们的物质生活得到了极大满足，近年来人们逐渐将消费的观念转到安全、无污染和绿色生态食品上来。但是，由于媒体和商家大量的不负责任的主观炒作，人们对农产品和农资安全问题的认识越来越狭隘，社会上也流传着种种关于化肥有害论的说法。为了纠正社会上的种种不正确观点，保护国家化肥工业的发展和正确引导消费者观念，就目前普遍存在的错误化肥观念问题作如下匡正：
错误观点一：自然界本含营养元素，何必花钱施用化肥
　　不错，自然界是含有大量的氮磷钾等营养元素，而且是相当全面的，但问题是这些营养元素是不是能够满足作物需要？大家都知道，植物生长是需要养分供给的，随着植物的生长，土壤中的营养元素被大量带走，作为提供植物营养的土壤单元只能提供有限的植物营养，不能自己再去增加失去的矿质元素，随着植物的一批一批的产出，势必会导致土壤营养元素的枯竭，如果只依赖于天然土壤，而不主动地加以补充，一定会造成植物大幅度减产。所以，施用化肥是补充土壤中养分的必要手段。
错误观点二：有机无机相违背，尤其不能使化肥。
　　这是完全错误的说法。到目前为止有机农业还没有公认的、严格的定义。我国绿色食品ＡＡ级标准规定允许使用天然、生物肥料，Ａ级标准规定可以有限度地使用化学肥料；欧洲制定有机农业标准的机构认为天然矿物肥料更纯净、对环境无害。根据植物营养理论的基本观点，提供植物营养的物质是矿质养分，而化肥正是矿质养分形态的植物营养物质，事实证明，世界大约百分之三十到百分之五十的作物产量来源于化肥，如果放弃对肥料的施用的话，这些产量仅靠有机肥是不能达到的，结果是可怕的。
错误观点三：化肥与有机肥养分相同，应该完全使用有机肥。
　　化肥是速效养分，施入土壤后可以被作物快速吸收利用，而有机肥则必须有一个被土壤微生物分解成无机态矿质营养的过程，这个过程是缓慢的。如果仅使用有机肥，则难以在短时间内满足作物全面、充足的养分需求，也就难以实现作物的高产、高质。另外，有机肥料中氮、磷、钾比例差异很大，对其中矿质元素的控制也是难以实现的，仅使用有机肥料难以达到平衡施肥的要求，而且对作物的生长也不能辨别是有利的还是有害的。
错误观点四：有机肥保护环境，化肥造成污染
任何事物都尤其双面性。事实证明，正确地施用肥料不会对环境构成威胁。常规农业的高产使我们在有限的土地上获得了充足的食物，如果全部依赖有机农业，人类就需要大面积开垦耕地以满足对食物的需要，这将对环境和野生动物造成更大的影响。而且，有机肥料如果施用的不当一样会对环境造成危害，如没有腐熟的农家肥施入土壤，其中的病毒、病菌不但会毒害土壤，还会给作物带来病害，另外，还造成蚊蝇大量滋生，造成疾病传播，同样给人们生活带来危害。 
错误观点五：化肥淋失污染了河流、海洋，造成富营养化。
　　虽然化肥的淋失可造成水体污染，但是水体污染的因素很多，化肥并不是主要因素。另外，不论施用有机肥料和化肥都可能淋失，都可能对水体造成污染。如农家肥堆放不好，就会流入水体，造成水体的富营养化污染等等。如果在化肥施用时，控制好施肥时机和氮、磷、钾施用量，采用科学的施肥方法，则化肥的淋失就很容易控制。